بررسی الگوی مقاومت وفراوانی ژن های مقاومت دارویی hcp,per,veb, درایزوله های آسینتو باکتر بومانی از بیمارستان های دانشگاهی
چکیده
در سالهای اخیر شمار روز افزون کلونیزاسیون اسینتوباکتر بومانی در بیماران بستری شده در بیمارستان به خصوص در بیماران تحت درمان با استفاده از انتی بیوتیک های وسیع الطیف و داروهای ضدسرطان را شاهد هستیم.همچنین کلونیزاسیون سویه های مقاوم به انتی بیوتیک ها یکی از فاکتورهای مهم در ایجاد عفونت های کسب شده از بیمارستان در بخش هایی نظیر ICU مراقبت های ویژه شده است.در این بین بتالاکتامازها مانند blaPER,blaVEB در سویه های اسینتوباکتربومانی وجود دارد.در کرمان فراوانی این گونه ژنها مشخص شده نبوده و هدف از این مطالعه تخمین مقاومت دارویی و فراوانی ژنهای مورد نظر در ایزوله ای جدا شده از بیماران با استفاده از تکنیک های مولکولی می باشد.برای اولین بار ما ژن hcp را سویه های اسینتوباکتر بومانی به عنوان تنها پروتئین اصلی از سیستم ترشحی تیپ 6 تشخیص دادیم.این سیستم یک مجموعه از ماکرومولکول هاست که توانایی رقابت با دیگر باکتریها و مقاومت های انتی باکتریال را افزایش می دهد.
مواد و روش ها :در زمستان سال 94 بررسی بر روی 114 نمونه جدا شده از بیماران در بیمارستا نهای کرمان انجام شد .بعد از جمع اوری نمونه ها کشت و ازمایشهای بیوشیمیایی برای تشخیص گونه اسینتوباکتر بومانی انجام شده و تست حساسیت انتی بیوتیکی با روش دیسک دیفیوژن (کربی بائر( و فراوانی سویه های مولد ESBL به روش دیسک ترکیبی انجام شد.ژن های بتالاکتاماز با استفاده از روش PCR و پرایمرهای اختصاصی تشخیص داده شد.
یافته ها: ژن blaOXA-51 در تمام ایزوله ها یافت شد.بالای نود درصد ایزوله ها به سفپیم و سفتازیدیم مقاوم بودند.بیشتر انها به ایمی پنم ومروپنم جنتامایسین امیکاسین ازوترونام سیپروفلوکساسین سفتازیدیم لووفلوکساسین تتراسایکلین و پیپراسیلین-تازوباکتام مقاومت زیادی داشتند .بالاترین مقاومت میان صد ایزوله به سفالوسپورین ها و کارباپنم ها و کمترین مقاومت نسبت پلی میکسین B و تجیسایکلین مشاهده شد.فراوانی ژن های blaVEB 13(13.7%)و hcp 52 (46.5) و ژن blaPER در هیچ یک از ایزوله ها یافت نشد.
نتیجه : اطالاعات جمع اوری شده نشان میدهد مقاومت بالای اسینتوباکتر بومانی به سفالوسپورین ها (سفی پیم و سفتریاکسون ) ضرورت استفاده از داروهای جدید مانند تجیسایکلین را برای درمان عفونت های اسینتوباکتر خاطر نشان میکند.مبارزه علیه این میکروارگانیسم در بیمارستانها و پیچیده شدن روند درمان بر نظارت کمیته کنترل و پیشگیری بر داشتن دستورالعمل هایی برای تجویز و استفاده از انتی بیوتیک ها تاکید دارد.
کلمات کلیدی:
اسینتوباکتر بومانی وبتالاکتاماز های وسیع الطیف و T6SS .
Introduction: Nowadays, there is an increasing number of colonization with Acinetobacter baumannii in hospitalized patients, especially in patients that treated with broad-spectrum antibiotics and anticancer drugs. Also antibiotic resistant strains colonization is an important factor leading to nosocomial dissemination of the organism especially in ICU ward. ESBL has different types that blaper and blaveb is commonly among them. Since in kerman, the frequency of these genes in Acinetobacter baumannii is not specified, this study aimed to evaluate drug resistance and frequency of genes of blaper and blaveb in isolated from patients and molecular technique was implemented. For the first time we detected hcp gene to confirmed that existance the only core proein of type 6 secretion system HCP in acinetbacter baumanii. Type VI secretion systems (T6SS) are a class of macromolecular secretion machines that are utilized by a number of bacteria for inter-bacterial competition or to elicit responses in eukaryotic cells and resistance to antibiotics.
Mterial & Method: In2015 winter, The clinical study on 114 samples collected from four hospitals in kerman , was performed. After collecting samples using culture and biochemical species Acinetobacter baumannii were identified. Antibiotic susceptibility tests were performed by Kirby-bauer disc diffusion and the frequency of ESBL producers was evaluated by CDDT .the betalactamase genes were detected by PCR and specific primers..
Results: blaOXA-51 gene was detected in all of isolates. Above of 90% of isolsate were resistant to cefepime and cefotaxime. Almost all of them were resistant to imipenem, meropenem, gentamicin, amikacin, aztreonam, ciprofloxacin, ceftazidim, levofloxacin, tetracycline and piperacillin-tazobactam. According to the results of the initial screening, The highest resistance was showed to all cefalosporines in 100 samples isolated and lowest resistance was to polymyxin B and tigycyclin.
The rates of susceptibility to polymyxin-B and tigecycline were 61/1% and 23/2% respectively. The frequency of, blaVEB and hcp are 52(46.5), 13 (13.7%) respectively. None of the isolates were carried blaPER gene.
Conclusion: The data presented showed high rates of Acinetobacter baumannii resistant to cefalosporines ,cefepime & ceftriaxone , emphasize the necessity of using newer drugs, such as tygecyclin, for treating Acinetobacter infections.The fight against these microorganisms in hospitals can be accomplished through the constant presence of the hospital infection control committee, recognizing the local microbiota and having protocols for a rational use of antimicrobials.
Key words:
Acinetobacter baumanii, ; Extended-Spectrum beta-Lactamase,T6SS
فهرست مطالب
فهرست مطالب
عنوان صفحه
4-1. خصوصیات فیزیولوژی و متابولیسم و رشد. 5
7-1. مهمترین گونه های اسینتوباکتر از لحاظ کلینیکی.. 7
10-1. اسینتوباکتر بومانی بعنوان پاتوژن بیمارستانی.. 8
1-12-1. پنومونی بیمارستانی.. 9
4-12-1. عفونتهای دستگاه ادراری… 9
13-1. فاکتورهای خطر که بیماران را مستعد به عفونت اسینتوباکتر بومانی می کند. 10
14-1. بیماری زایی گونه های اسینتوباکتر. 10
1-15-1. لیپوپلی ساکارید (LPS) 10
5-15-1. پروتینهای غشای خارجی.. 11
7-15-1. Stress Response- mechanism…. 12
عنوان صفحه
16-1. مقاومت چندگانه Multidrug resistance (MDR) 12
1-16-1. درمان پنومونی ناشی از اسینتوباکتر بومانی مقاوم به کارباپنم ها 13
18-1. مکانیسم های مقاومت اسینتوباکتر بومانی در برابرآنتی بیوتیک ها 16
1-18-1. تغییرات نفوذپذیری و فعالیت افلاکس ممانعت از رسیدن آنتی بیوتیک به سایت هدف: 16
2-18-1. غیر فعال کردن یا تغییر درساختمان آنتی بیوتیک قبل از رسیدن به هدف: 16
3-18-1. تاثیر سیستم های ترشحی در بازخورد انتی بیوتیک ها: 17
4-18-1. مکانیزم مقاومت به بتالاکتام ها 18
5-18-1. مکانیسم های آنزیمی: 18
6-18-1. مکانیسم های غیر آنزیمی: 19
19-1. طبقه بندی مولکولی بتالاکتامازها (lactamases -beta) 20
1-19-1. کلاس A بتالاکتامازها (β lactamase-A) 20
2-19-1. کلاس B بتالاکتامازها (beta-lactamases) 20
3-19-1. بتالاکتامازهای غیر شایع (beta_lactamases): 20
4-19-1. کلاس C بتالاکتامازها (C -lactamases-beta) 21
5-19-1. کلاس D بتالاکتامازها (D beta lactamases) 21
1-20-1. بتالاکتامازهای تیپ SHV: 22
2-20-1. بتالاکتامازهای تیپ TEM: 23
3-20-1. بتالاکتامازهای تیپ OXA: 23
4-20-1. بتالاکتامازهای تیپ CTX-M: 23
5-20-1. بتالاکتامازهای تیپ PER: 23
عنوان صفحه
6-20-1. بتالاکتامازهای تیپ VEB: 24
7-20-1. بتالاکتامازهای وسیع الطیف: 25
21-1.خصوصیات آنتی بیوتیک های وسیع الطیف: 25
1-21-1. حساسیت ESBL ها در مقابل آنتی بیوتیک ها: 25
2-21-1.درمان عفونت های ایجاد شده توسط سویه های مولد ESBL: 26
22-1. آنزیم های تغییر دهنده آمینوگلیکوزیدها AMEs(modifying -Aminoglycoside enzymes) 26
1-22-1. متیلاسیون s rRNA) (Methylation of 16.. 27
2-22-1. مکانیزم مقاومت به تتراسیکلین.. 27
3-22-2. مکانیزم مقاومت به کوئینولون ها 27
4-22-1. مکانیزم مقاومت به پلی میکسین.. 28
4-23-1. عناصر ژنتیکی متحرک… 28
8-23-1.IS (Insertion sequence) 29
24-1. بیان مسئله وضرورت اجرای طرح.. 29
26-1. فرضیات یا سوالات پژوهش: 32
3-2. روش محاسبه حجم نمونه و تعداد آن. 37
عنوان صفحه
5-2. جمع آوری نمونه های بالینی.. 38
7-2. محیط های کشت مورد استفاده در مطالعه: 38
8-2. دیسک های آنتی بیوتیکی مورد استفاده جهت آنتی بیوگرام. 39
9-2. دستگاه مورد نیاز جهت انجام PCR… 39
10-2. سویه های استاندارد بکار رفته جهت تنظیم کردن روش PCR… 39
11-2. پرایمرهای مورد استفاده جهت انجام PCR… 40
12-2. نحوه ساخت محلولهای مورد نیازو محیطهای کشت… 40
1-12-2. طرز ساخت محلول اکسیداز 40
2-12-2. طرز تهیه محیط های کشت… 40
3-12-2. طرز تهیه بافر TAE 20X… 40
14-2. کشت وازمایشات تعیین هویت: 41
1-13-2. تهیه سوسپانسیون میکروبی معادل نیم مک فارلند. 42
2-13-2 .تلقیح به محیط های کشت: 42
14-2. سنجش حساسیت نسبت به انتی بیوتیک ها به روش دیسک دیفیوژن.. 43
16-2. طراحی پرایمر توسط برنامه ALLEL ID… 44
1-16-2. جستجوی توالی مورد نظر در پایگاه NCBI. 44
17-2. روش استخراج DNA جهت انجام PCR: 45
18-2. اندازه گیری کمی و کیفی DNA استخراج شده. 45
19-2. آماده کردن مخلوط نهایی جهت انجام PCR… 46
20-2. تشخیص گونه اسینتوباکتر بومانی به روش PCR برای ژن blaoxa51.. 46
21-2. set up واکنش pcr برای شناسایی ژن های blaPER,blaVEB… 46
1-21-2.set up واکنش pcr برای شناسایی ژن hcp.. 46
1-3. نمونه های بالینی اسینتوباکتر بومانی: 49
2-3. نتیجه تست های افتراقی برای گونه های اسینتوباکتر بومانی: 49
3-3. بررسی نتایج به روش دیسک دیفیوژن برای ایزوله های اسینتوباکتر بومانی: 50
4-3. نتیجه سنجش بتالاکتامازها به صورت فنوتیپی به روش دیسک ترکیبی: 51
عنوان صفحه
5-3. بررسی کمی و کیفی استخراج DNA… 52
6-3. تشخیص ژنهای بتالاکتاماز 54
7-3.تشخیص ژن های اصلی سیستم ترشحی تیپ 6. 56
فهرست جداول
عنوان صفحه
جدول 1-1. طبقه بندی جنس اسینتوباکتر بر اساس کتاب باکتری شناسی سیستماتیک برجی.. 3
جدول 2-1. طبقه بندی گونه های اسینتوباکتر از آغاز تا کنون(17) 4
جدول 1-2: انواع بتالاکتامازها 24
جدول 1-2: متغیرهای تحقیق (نگارنده) 36
جدول 2-2: محیطهای کشت مورد استفاده در مطالعه. 38
جدول 3-2: دیسک های آنتی بیوتیکی مورد استفاده جهت آنتی بیوگرام. 39
جدول 4-2: دستگاه های مورد نیاز جهت انجام PCR… 39
جدول 5-2: سویه های استاندارد بکار رفته جهت تنظیم کردن روش PCR… 39
جدول 6-2: پرایمرهای مورد استفاده جهت انجام PCR… 40
جدول 7-2: خصوصیات بیو شیمیایی اسینتوباکتر بومانی.. 42
جدول 8-2: برنامه انجام واکنش PCR برای ژن per. 46
جدول 9-2: برنامه انجام واکنش PCR برای ژن Veb.. 46
جدول 10-2: برنامه انجام واکنش PCR برای ژن hcp.. 47
جدول 1-3: فراوانی اسینتوباکتر بومانی در نمونه کلینیکی مورد بررسی: 49
جدول 2-3. درصد مقاومت های انتی بیوتیکی در نمونه های بالینی.. 50
فهرست نمودارها
عنوان صفحه
نمودار 1-3: تعیین حساسیت آنتی بیوتیکی به روش دیسک دیفیوژن.. 50
نمودار 2-3: درصد مقاومت مشاهده شده در بین ایزوله های جدا شده از بیماران.. 52
فهرست اشکال
عنوان صفحه
شکل 1-1: اجزای سیستم ترشحی تیپ 6. 17
شکل 1-2: توضیحات نرم افزار ALLEL Id.. 44
شکل 2-2: صفحه ی جستجو در سایت NCBI www.ncbi.nlm.nih.gov.. 45
شکل 1-3: کلنی های اسینتو باکتر بومانی در محیط Mac Conkey. 49
شکل 2-3: بررسی کیفی. الکتروفورز نمونه‌هاي DNA استخراج شده با روش جوشاندن بر روي ژل آگارز 1. 53
شکل 4-3: نتایج بدست آمده در بررسی ژن کد کننده آنزیم bla per. 54
شکل 5-3: نتایج بدست آمده در بررسی ژن کد کننده آنزیم blaveb: 55
شکل 6-3: نتایج بدست آمده در بررسی ژن کد کننده پروتئین hcp: 56
منابع فارسی
- فرد ص, نورخدا. بررسی میزان مقاومت دارویی سویه های اسینتوباکتر بومانی و سایر گونه هـای اسینتوباکتـر. مجله علمی پزوهشی دانشگاه علوم پزشکی ایلام. 2006;14(3):29–36.
منابع انگلیسی
- Nazari Monazam A, Hosseini Doust SR, Mirnejad R. Prevalence PER and VEB beta-lactamase Genes among Acinetobacter baumannii Isolated from Patients in Tehran by PCR. Iran J Med Microbiol. 2015;8(4):28–35.
- Oh SJ, Lee SU, Hwang HY, Bae IK, Jo HS, Lee BH, et al. Prevalence of class A extended-spectrum β-lactamases in clinical isolates of Acinetobacter baumannii and Pseudomonas aeruginosa. Korean J Lab Med. 2006;26(1):14–20.
- Fallah F, Noori M, Hashemi A, Goudarzi H, Karimi A, Erfanimanesh S, et al. Prevalence of bla NDM, bla PER, bla VEB, bla IMP, and bla VIM Genes among Acinetobacter baumannii Isolated from Two Hospitals of Tehran, Iran. Scientifica(Cairo). 2014;2014(Vim):245162-.
- Farajnia S, Azhari F, Alikhani MY, Hosseini MK, Peymani A, Sohrabi N. Prevalence of PER and VEB type extended spectrum betalactamases among multidrug resistant Acinetobacter baumannii isolates in North-West of Iran. Iran J Basic Med Sci. 2013;16(6):751–5.
- Carruthers MD, Nicholson PA, Tracy EN, Munson Jr RS. Acinetobacter baumannii utilizes a type VI secretion system for bacterial competition. PLoS One. 2013;8(3):e59388.
- Carruthers MD, Nicholson PA, Tracy EN, Munson RS. Acinetobacter baumannii Utilizes a Type VI Secretion System for Bacterial Competition. PLoS One. 2013;8(3).
- Ruiz FM, Santillana E, Spínola-Amilibia M, Torreira E, Culebras E, Romero A. Crystal structure of Hcp from Acinetobacter baumannii: a component of the type VI secretion system. PLoS One. 2015;10(6):e0129691.
- Barbe V, Vallenet D, Fonknechten N, Kreimeyer A, Oztas S, Labarre L, et al. Unique features revealed by the genome sequence of Acinetobacter sp. ADP1, a versatile and naturally transformation competent bacterium. Nucleic Acids Res. 2004;32(19):5766–79.
- Bergogne-Berezin E, Towner KJ. Acinetobacter spp. as nosocomial pathogens: microbiological, clinical, and epidemiological features. Clin Microbiol Rev. 1996;9(2):148.
- Baumann P, Doudoroff M, Stanier RY. A study of the Moraxella group II. Oxidative-negative species (genus Acinetobacter). J Bacteriol. 1968;95(5):1520–41.
- Lessel EF. International Committee on Nomenclature of Bacteria Subcommittee on the Taxonomy of Moraxella and Allied Bacteria: Minutes of the Meeting, 11 August 1970. Room Constitution C, Maria-Isabel Hotel, Mexico City, Mexico. Int J Syst Evol Microbiol. 1971;21(2):213–4.
- Rossau R, Van Landschoot A, Gillis M, De Ley J. Taxonomy of Moraxellaceae fam. nov., a new bacterial family to accommodate the genera Moraxella, Acinetobacter, and Psychrobacter and related organisms. Int J Syst Evol Microbiol. 1991;41(2):310–9.
- Peleg AY, Seifert H, Paterson DL. Acinetobacter baumannii: emergence of a successful pathogen. Clin Microbiol Rev. 2008;21(3):538–82.
- Bouvet PJM, Jeanjean S. Delineation of new proteolytic genomic species in the genus Acinetobacter. Res Microbiol. 1989;140(4):291–9.
- TJERNBERG I, Ursing JAN. Clinical strains of Acinetobacter classified by DNA‐DNA hybridization. Apmis. 1989;97(7‐12):595–605.
- Tønjum T, Brandtzæg P, Henriques-Normark B. Meningitis. In: The Prokaryotes. Springer; 2013. p. 401–27.
- Martí S, Rodríguez-Baño J, Catel-Ferreira M, Jouenne T, Vila J, Seifert H, et al. Biofilm formation at the solid-liquid and air-liquid interfaces by Acinetobacter species. BMC Res Notes. 2011;4(1):1.
- Fournier PE, Richet H, Weinstein RA. The epidemiology and control of Acinetobacter baumannii in health care facilities. Clin Infect Dis. 2006;42(5):692–9.
- Nahar A, Anwar S, Saleh AA, Miah MRA. Virulence Factors and Antibiotic Susceptibility Pattern of Acinetobacter Species in a Tertiary Care Hospital in Bangladesh. Ibrahim Med Coll J. 2013;6(1):27–30.
- Jawad A, Hawkey PM, Heritage J, Snelling AM. Description of Leeds Acinetobacter Medium, a new selective and differential medium for isolation of clinically important Acinetobacter spp., and comparison with Herellea agar and Holton’s agar. J Clin Microbiol. 1994;32(10):2353–8.
- Lin Y-C, Sheng W-H, Chang S-C, Wang J-T, Chen Y-C, Wu R-J, et al. Application of a microsphere-based array for rapid identification of Acinetobacter spp. with distinct antimicrobial susceptibilities. J Clin Microbiol. 2008;46(2):612–7.
- Martinez EC, Blanco VMR, Suárez MLR, Llosa C, Asensio MT, Torrico AM. Infective endocarditis of an interventricular patch caused byAcinetobacter haemolyticus. Infection. 1995;23(4):243–5.
- De Beaufort AJ, Bernards AT, Dijkshoorn L, Van Boven CPA. Acinetobacter junii causes life-threatening sepsis in preterm infants. Acta Paediatr. 1999;88(7):772–5.
- Seifert H, Strate A, Schulze A, Pulverer G. Vascular Catheter—Related Bloodstream Infection Due to Acinetobacter johnsonii (Formerly Acinetobacter calcoaceticus var. lwoffii): Report of 13 Cases. Clin Infect Dis. 1993;17(4):632–6.
- Reboli AC, Houston ED, Monteforte JS, Wood CA, Hamill RJ. Discrimination of epidemic and sporadic isolates of Acinetobacter baumannii by repetitive element PCR-mediated DNA fingerprinting. J Clin Microbiol. 1994;32(11):2635–40.
- Berlau J, Aucken HM, Houang E, Pitt TL. Isolation of Acinetobacter spp including A. baumannii from vegetables: implications for hospital-acquired infections. J Hosp Infect. 1999;42(3):201–4.
- Jawad A, Heritage J, Snelling AM, Gascoyne-Binzi DM, Hawkey PM. Influence of relative humidity and suspending menstrua on survival of Acinetobacter spp. on dry surfaces. J Clin Microbiol. 1996;34(12):2881–7.
- Jawad A, Seifert H, Snelling AM, Heritage J, Hawkey PM. Survival of Acinetobacter baumannii on dry surfaces: comparison of outbreak and sporadic isolates. J Clin Microbiol. 1998;36(7):1938–41.
- Wendt C, Dietze B, Dietz E, Rüden H. Survival of Acinetobacter baumannii on dry surfaces. J Clin Microbiol. 1997;35(6):1394–7.
- Hirai Y. Survival of bacteria under dry conditions; from a viewpoint of nosocomial infection. J Hosp Infect. 1991;19(3):191–200.
- Perez F, Hujer AM, Hujer KM, Decker BK, Rather PN, Bonomo RA. Global challenge of multidrug-resistant Acinetobacter baumannii. Antimicrob Agents Chemother. 2007;51(10):3471–84.
- Cisneros JM, Pachón J. Acinetobacter baumannii: un patógeno nosocomial de difícil control. Enferm Infecc Microbiol Clin. 2003;21(5):221–3.
- Dijkshoorn L, Nemec A, Seifert H. An increasing threat in hospitals: multidrug-resistant Acinetobacter baumannii. Nat Rev Microbiol. 2007;5(12):939–51.
- Falagas ME, Karveli EA, Kelesidis I, Kelesidis T. Community-acquired Acinetobacter infections. Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 2007;26(12):857–68.
- Joly‐Guillou M. Clinical impact and pathogenicity of Acinetobacter. Clin Microbiol Infect. 2005;11(11):868–73.
- García-Garmendia J-L, Ortiz-Leyba C, Garnacho-Montero J, Jiménez-Jiménez F-J, Monterrubio-Villar J, Gili-Miner M. Mortality and the increase in length of stay attributable to the acquisition of Acinetobacter in critically ill patients. Crit Care Med. 1999;27(9):1794–9.
- Cisneros JM, Rodriguez‐Bano J. Nosocomial bacteremia due to Acinetobacter baumannii: epidemiology, clinical features and treatment. Clin Microbiol Infect. 2002;8(11):687–93.
- Hoffmann S, Mabeck CE, Vejlsgaard R. Bacteriuria caused by Acinetobacter calcoaceticus biovars in a normal population and in general practice. J Clin Microbiol. 1982;16(3):443–51.
- Falagas ME, Bliziotis IA, Siempos II. Attributable mortality of Acinetobacter baumannii infections in critically ill patients: a systematic review of matched cohort and case-control studies. Crit care. 2006;10(2):1.
- Simões LC, Simoes M, Vieira MJ. Biofilm interactions between distinct bacterial genera isolated from drinking water. Appl Environ Microbiol. 2007;73(19):6192–200.
- Smith MG, Gianoulis TA, Pukatzki S, Mekalanos JJ, Ornston LN, Gerstein M, et al. New insights into Acinetobacter baumannii pathogenesis revealed by high-density pyrosequencing and transposon mutagenesis. Genes Dev. 2007;21(5):601–14.
- Donlan RM. Biofilms: microbial life on surfaces. Emerg Infect Dis. 2002;8(9).
- Choi CH, Hyun SH, Lee JY, Lee JS, Lee YS, Kim S, et al. Acinetobacter baumannii outer membrane protein A targets the nucleus and induces cytotoxicity. Cell Microbiol. 2008;10(2):309–19.
- Pukatzki S, Ma AT, Sturtevant D, Krastins B, Sarracino D, Nelson WC, et al. Identification of a conserved bacterial protein secretion system in Vibrio cholerae using the Dictyostelium host model system. Proc Natl Acad Sci. 2006;103(5):1528–33.
- McGowan JE. Resistance in nonfermenting gram-negative bacteria: multidrug resistance to the maximum. Am J Med. 2006;119(6):S29–36.
- Jain R, Danziger LH. Multidrug-resistant Acinetobacter infections: an emerging challenge to clinicians. Ann Pharmacother. 2004;38(9):1449–59.
- Peleg AY, Franklin C, Bell JM, Spelman DW. Emergence of carbapenem resistance in Acinetobacter baumannii recovered from blood cultures in Australia. Infect Control. 2006;27(7):759–61.
- Karageorgopoulos DE, Kelesidis T, Kelesidis I, Falagas ME. Tigecycline for the treatment of multidrug-resistant (including carbapenem-resistant) Acinetobacter infections: a review of the scientific evidence. J Antimicrob Chemother. 2008;62(1):45–55.
- Cisneros-Herreros JM, Garnacho-Montero J, Pachón-Ibáñez ME. Neumonía nosocomial por Acinetobacter baumannii. Enferm Infecc Microbiol Clin. 2005;23:46–51.
- Clausell A, Garcia-Subirats M, Pujol M, Busquets MA, Rabanal F, Cajal Y. Gram-negative outer and inner membrane models: insertion of cyclic cationic lipopeptides. J Phys Chem B. 2007;111(3):551–63.
- Fluit AC, Florijn A, Verhoef J, Milatovic D. Presence of tetracycline resistance determinants and susceptibility to tigecycline and minocycline. Antimicrob Agents Chemother. 2005;49(4):1636–8.
- Mahgoub S, Ahmed J, Glatt AE. Underlying characteristics of patients harboring highly resistant Acinetobacter baumannii. Am J Infect Control. 2002;30(7):386–90.
- Doughari HJ, Ndakidemi PA, Human IS, Benade S. The ecology, biology and pathogenesis of Acinetobacter spp.: an overview. Microbes Environ. 2011;26(2):101–12.
- Van den Broek PJ, Arends J, Bernards AT, De Brauwer E, Mascini EM, Van Der Reijden TJK, et al. Epidemiology of multiple Acinetobacter outbreaks in The Netherlands during the period 1999–2001. Clin Microbiol Infect. 2006;12(9):837–43.
- Murray CK, Hospenthal DR. Treatment of multidrug resistant Acinetobacter. Curr Opin Infect Dis. 2005;18(6):502–6.
- Mahgoub S, Ahmed J, Glatt AE. Completely resistant Acinetobacter baumannii strains. Infect Control Hosp Epidemiol. 2002;23(8):477–9.
- Hawkey PM. The origins and molecular basis of antibiotic resistance. Br Med J. 1998;317(7159):657.
- Quale J, Bratu S, Landman D, Heddurshetti R. Molecular epidemiology and mechanisms of carbapenem resistance in Acinetobacter baumannii endemic in New York City. Clin Infect Dis. 2003;37(2):214–20.
- Rivera-Jacinto M, Rodríguez-Ulloa C, Huayán-Dávila G. Frequency of Staphylococcus aureus environmental isolations and beta-lactamase activity at a hospital of Cajamarca, Perú. Infectio. 2009;13(3):192–5.
- Coito AMB do. Bacterial communities and antibiotic resistance genes in hospital effluents and municipal wastewaters of Aveiro. Universidade de Aveiro; 2015.
- Helb D, Jones M, Story E, Boehme C, Wallace E, Ho K, et al. Rapid detection of Mycobacterium tuberculosis and rifampin resistance by use of on-demand, near-patient technology. J Clin Microbiol. 2010;48(1):229–37.
- Evans BA, Hamouda A, Amyes SGB. OXA-type β-lactamases in Acinetobacter baumannii: emerging from the shadow of the extended-spectrum β-lactamases. Rev Med Microbiol. 2007;18(4):63–72.
- Randegger CC, Keller A, Irla M, Wada A, Hächler H. Contribution of natural amino acid substitutions in SHV extended-spectrum β-lactamases to resistance against various β-lactams. Antimicrob Agents Chemother. 2000;44(10):2759–63.
- Sirot D, Recule C, Chaibi EB, Bret L, Croize J, Chanal-Claris C, et al. A complex mutant of TEM-1 beta-lactamase with mutations encountered in both IRT-4 and extended-spectrum TEM-15, produced by an Escherichia coli clinical isolate. Antimicrob Agents Chemother. 1997;41(6):1322–5.
- Brown S, Amyes S. OXA β-lactamases in Acinetobacter: the story so far. J Antimicrob Chemother. 2006;57(1):1–3.
- Endimiani A, Hujer AM, Hujer KM, Gatta JA, Schriver AC, Jacobs MR, et al. Evaluation of a commercial microarray system for detection of SHV-, TEM-, CTX-M-, and KPC-type β-lactamase genes in Gram-negative isolates. J Clin Microbiol. 2010;48(7):2618–22.
- Keys TF. Beta-Lactam Antibiotics for Clinical Use. Ther Drug Monit. 1987;9(1):126.
- Siroy A, Cosette P, Seyer D, Lemaître-Guillier C, Vallenet D, Van Dorsselaer A, et al. Global comparison of the membrane subproteomes between a multidrug-resistant Acinetobacter baumannii strain and a reference strain. J Proteome Res. 2006;5(12):3385–98.
- Vila J, Martí S, Sánchez-Céspedes J. Porins, efflux pumps and multidrug resistance in Acinetobacter baumannii. J Antimicrob Chemother. 2007;59(6):1210–5.
- Marchand I, Damier-Piolle L, Courvalin P, Lambert T. Expression of the RND-type efflux pump AdeABC in Acinetobacter baumannii is regulated by the AdeRS two-component system. Antimicrob Agents Chemother. 2004;48(9):3298–304.
- Datta P, Thakur A, Mishra B, Gupta V. Prevalence of clinical strains resistant to various beta-lactams in a tertiary care hospital in India. Jpn J Infect Dis. 2004;57(4):146–9.
- McKendrick MW, Read NW. Irritable bowel syndrome—post salmonella infection. J Infect. 1994;29(1):1–3.
- Song JY, Kee SY, Hwang IS, Seo Y Bin, Jeong HW, Kim WJ, et al. In vitro activities of carbapenem/sulbactam combination, colistin, colistin/rifampicin combination and tigecycline against carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii. J Antimicrob Chemother. 2007;60(2):317–22.
- Weber BS, Ly PM, Irwin JN, Pukatzki S, Feldman MF. A multidrug resistance plasmid contains the molecular switch for type VI secretion in Acinetobacter baumannii. Proc Natl Acad Sci U S A [Internet]. 2015;112(30):9442–7. Available from: http://www.pnas.org/content/112/30/9442.full
- Cicek AC, Saral A, Iraz M, Ceylan A, Duzgun AO, Peleg AY, et al. OXA- and GES-type beta-lactamases predominate in extensively drug-resistant Acinetobacter baumannii isolates from a Turkish University Hospital. Clin Microbiol Infect. 2014 May;20(5):410–5.
